তাকাশি নাতসুমে একজন ১৫ বছর বয়সী ছেলে, যার একটাই ইচ্ছে । সব মানুষের মতো স্বাভাবিক জীবন যাপন করা। কিন্তু দুর্ভাগ্যজনকভাবে, তার মৃত দাদীমা রেইকোর মতোই, সে অদৃশ্য আত্মা বা "ইউকাই" দেখতে পায়। একসময় নাতসুমে জানতে পারে, তার দাদীমা রেইকো একটি রহস্যময় বই রেখে গেছেন—"বন্ধুদের খাতা" নামে পরিচিত—যেখানে তিনি বিভিন্ন ইউকাইদের নাম লিখে তাদের সঙ্গে চুক্তি বেঁধে ফেলেছিলেন। কিন্তু রেইকো কখনোই তাদের নাম ব্যবহার করে ডেকে নেননি, ফলে সেই আত্মারা বন্দী অবস্থায় রয়ে গেছে।