তাতসুও কুসাকাবে ও তার দুই মেয়ে, সৎসুকি এবং মেইকে নিয়ে এক গ্রামের দিকে স্থানান্তিত হন, যাতে সৎসুকি এবং মেই তাদের মায়ের কাছাকাছি থাকতে পারে, যিনি দীর্ঘমেয়াদি অসুস্থতার কারণে হাসপাতালে ভর্তি। গ্রামের জীবনের সাথে ধীরে ধীরে পরিচিত হয়ে ওঠার সময়, একদিন মেই উঠানে একটি ছোট, খরগোশের মতো প্রাণী দেখতে পায়। সেটিকে তাড়া করে বনের মধ্যে চলে গেলে, সে আবিষ্কার করে "তোতোরো"কে—একটি বিশাল, মায়াময় বন আত্মা, যার সাথে দ্রুতই তার বন্ধুত্ব গড়ে ওঠে। কিছুদিন পর সৎসুকিও তোতোরোর সঙ্গে দেখা করে, আর এই দুই বোনের জীবন হঠাৎ করেই জাদুকরী প্রাকৃতিক অ্যাডভেঞ্চার এবং বনের রহস্যময় প্রাণীদের সঙ্গে ভরে ওঠে।