পৃথিবীকে হঠাৎ এক রহস্যময় আলো গ্রাস করলে মানবজাতি ভয়ে জমে যায়, আর সবাই পাথরে রূপান্তরিত হয়। হাজার হাজার বছর পরে, পৃথিবী আবার সবুজে ভরে ওঠে—জঙ্গলে ঢেকে যায় সেই শহরগুলো, যেগুলো একসময় গর্বের সাথে দাঁড়িয়ে ছিল। এই দীর্ঘ "পাথরের কারাগার" থেকে প্রথম দিকেই বেরিয়ে আসে তাইজু ওওকি। সে আবিষ্কার করে, তার ঘনিষ্ঠ বন্ধু ও প্রতিভাবান তরুণ বিজ্ঞানী সেনকু তার জাগরণের জন্য প্রস্তুতি নিয়ে রেখেছিল। তাইজুর ইচ্ছা তার ভালোবাসার মানুষটিকে বাঁচানো, কিন্তু সেনকুর লক্ষ্য হলো এই অদ্ভুত ঘটনার কারণ উদঘাটন করা এবং পৃথিবীকে আগের গৌরবে ফিরিয়ে আনা। কিন্তু তারা যখন অচেনা এই বিপজ্জনক পৃথিবীতে সুবিধা নিতে ভয়ঙ্কর শক্তিশালী সুকাসা শিশিও-কে মুক্ত করে, তখন তারা বুঝতে পারে নতুন এই সঙ্গীর পরিকল্পনা ভিন্ন। সুকাসা এই পরিস্থিতিকে নতুনভাবে শুরু করার সুযোগ হিসেবে দেখে; প্রযুক্তির দুর্নীতি আর ধ্বংস থেকে মুক্ত হয়ে সে নিজের লক্ষ্য পূরণে কিছুতেই থামবে না। একে অপরের মতের সাথে একেবারেই একমত হতে না পেরে, সেনকুর বিজ্ঞানের প্রতি একনিষ্ঠ বিশ্বাসের সঙ্গে সুকাসার প্রাকৃতিক প্রবৃত্তির সংঘর্ষ শুরু হয়—যা সত্যিকারের এক যুগান্তকারী লড়াইয়ে রূপ নেয়।